医疗大数据开发中的基础设施建设

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医疗大数据基础设施的独特性➢医疗大数据平台与传统医院IT设施的不同•业务信息系统:支撑日常医院业务运行,以事务处理为主,重复性、实时性高•医疗大数据平台:数据的二次分析利用,以批量数据分析为主,随机性、非实时性突出•同一套基础设施难以兼顾两类不同需求业务数据中心数据分析中心原始数据智能模型应用医疗大数据基础设施的建设原则➢建设原则:需求驱动,合理适用➢考虑三大因素,共性与个性相结合医疗大数据特点•开发过程•数据类型与规模•应用模式•数据安全平台软件系统•技术架构•底层环境医院自身能力•领域范围•工作层次•应用规模共性因素个性因素因厂商而不同个性因素因医院而不同医疗大数据的开发流程➢典型地,医疗大数据的开发环节及过程为:数据自由检索特征变量提取专病数据库病例抽取缺失值处理数理统计分析机器学习建模深度学习AI组学数据分析数据ETL数据资源管理模型应用数据整合管理数据检索数据处理数据分析模型应用医疗大数据基础设施应满足以上各环节需求一、数据资源管理基础设施➢需求特点•功能作用:是医疗大数据平台的数据资源池(数据的“仓库”)和数据资源管理中心,负责各类原始数据归集和为各种数据利用提供数据•性能要求:无特殊要求,满足数据归集和日常管理需求即可•存储要求:数据分类管理,存储容量大,对存储性能要求不高•操作特点:增量抽取,模型转换,初始加工,归集管理,输出数据业务数据业务数据┇增量抽取模型转换归集整合数据管理数据资源池数据提供一、数据资源管理基础设施(续)➢技术选型•因对性能无特殊要求,且数据需要转换加工,选传统技术为宜•结构化数据:就目前医院数据量而言,传统关系数据库完全可以胜任•影像类数据:文件系统,普通性能大容量存储,如NAS、SAN,容量易扩充•组学类数据:文件系统,低性能大容量存储,如NAS•由于存储设备的特殊性,数据管理服务器并不宜采用虚拟化平台关系数据库结构化数据/文本数据医学影像/组学数据文件系统二、医疗数据检索基础平台➢需求特点•功能要求:自由条件检索,结构化数据的任意字段,文本数据全文检索•性能要求:响应速度快,复杂条件瞬间响应•操作要求:除专用的检索系统外,支持SQL手工检索基础平台检索系统SQL引擎SQL二、医疗数据检索基础平台(续)➢技术选型•硬件:分布式并行集群•架构:数据分布,按列组织或按列索引•选型:列数据库系统、Elasticsearch、基于Hadoop的Hbase等➢MPP列数据库的优势•数...

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